Перпендикуляр

Перпендикуляр - геометр. прямая линия, пересекающая какую-либо прямую под прямым углом (в 90 градусов).

Происходит от лат. perpendicularis «отвесный», далее из лат. perpendiculum «отвес» + лат. -ar, далее от perpendō «тщательно отвешивать; взвешивать; определять» + -culum (уменьшительный суффикс), далее от лат. per «через» +‎ pendō «вешать, отвешивать». Вероятно происходит от праиталийского *pendō, от праиндоевропейского *(s) pénd-e-ti, от *(s) pend- «тянуть; вращать». Возможно переосмысленный корень *(S) penh₁- «раскручивать (нить); растянуть», далее от *-dʰh₁eti, из *dʰeh₁- «делать». Русск. перпендикуляр заимствовано через нем. Реrреndiсulаr (ХVI в.), начиная с Петра I.

Если предположить, что в основе действительно слово со значением отвес, то в этом случае выглядит странно такая сложная лексическая конструкция, в которой можно разглядеть и предлог и два корня или предлог, корень и суффикс. Если это что-то вроде русс. поперечина, тогда этимология совсем не верна. В общем всё настолько хлипко, что можно предложить любую самую фантастическую версию. И при этом она точно не будет хуже.

пер- - тоже, что русс. приставка пере-, в значении "через"

Из словаря Даля:

пень - остаток, на корню, срубленного или сломанного дерева. В лесу дром да лом, пень да колода, лес торчком и сваленный. Зовут пнем и нижнюю часть живого дерева, от корневища (комля) до первых сучьев; верхняя: колода, лесина, голомя, голень.  | Всякая тупая, торчком стоящая вещь, обломок кола, столба в земле; остаток отрезанной руки, ноги, пальца...

колода - лежачее толстое дерево, бревно или немалый и толстый отрубок, срубленое голомя, лежачее дерево в лесу. Пень да колода...

Пень - это вертикальный объект (торчит), а колода - горизонтильный (лежит). Т.е. они взаимно перпендикулярны. Через пень колоду.

Пень да колода - это и есть перпендикуляр.

Перпендикулярный = перепеньдаколодный (через-пень-колодный).